MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT8513

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017207	GA	3	6	1366	1371	50 %	0 %	50 %	0 %	384183625
2	NC_017207	AAAG	2	8	1406	1413	75 %	0 %	25 %	0 %	384183625
3	NC_017207	ATT	2	6	1430	1435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183625
4	NC_017207	AATT	2	8	1497	1504	50 %	50 %	0 %	0 %	384183625
5	NC_017207	TGT	2	6	1558	1563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183625
6	NC_017207	TTG	2	6	1564	1569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183625
7	NC_017207	T	6	6	1654	1659	0 %	100 %	0 %	0 %	384183625
8	NC_017207	GAGAA	2	10	1674	1683	60 %	0 %	40 %	0 %	384183625
9	NC_017207	TGA	2	6	1708	1713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183625
10	NC_017207	A	6	6	1713	1718	100 %	0 %	0 %	0 %	384183625
11	NC_017207	AAAAAC	2	12	1755	1766	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384183625
12	NC_017207	T	6	6	1781	1786	0 %	100 %	0 %	0 %	384183625
13	NC_017207	GAAA	2	8	1837	1844	75 %	0 %	25 %	0 %	384183625
14	NC_017207	GTG	2	6	1863	1868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384183625
15	NC_017207	ACA	2	6	1921	1926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183625
16	NC_017207	AGA	2	6	1933	1938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183625
17	NC_017207	AAGAA	2	10	1947	1956	80 %	0 %	20 %	0 %	384183625
18	NC_017207	ATAG	2	8	1961	1968	50 %	25 %	25 %	0 %	384183625
19	NC_017207	GTC	2	6	2110	2115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183625
20	NC_017207	AGA	2	6	2128	2133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183625
21	NC_017207	AG	3	6	2192	2197	50 %	0 %	50 %	0 %	384183625
22	NC_017207	AG	3	6	2234	2239	50 %	0 %	50 %	0 %	384183625
23	NC_017207	GAAG	2	8	2251	2258	50 %	0 %	50 %	0 %	384183625
24	NC_017207	TGA	3	9	2404	2412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183625
25	NC_017207	GAA	2	6	2456	2461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183625
26	NC_017207	CAA	2	6	2462	2467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183625
27	NC_017207	GA	3	6	2522	2527	50 %	0 %	50 %	0 %	384183625
28	NC_017207	AGA	2	6	3082	3087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183626
29	NC_017207	TGAG	2	8	3091	3098	25 %	25 %	50 %	0 %	384183626
30	NC_017207	AGA	3	9	3163	3171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183626
31	NC_017207	GGA	2	6	3223	3228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384183626
32	NC_017207	GAT	2	6	3260	3265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183626
33	NC_017207	AAAG	2	8	3287	3294	75 %	0 %	25 %	0 %	384183626
34	NC_017207	T	7	7	3301	3307	0 %	100 %	0 %	0 %	384183626
35	NC_017207	GAC	2	6	3314	3319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384183626
36	NC_017207	TAA	2	6	3365	3370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183626
37	NC_017207	TCA	2	6	3463	3468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183626
38	NC_017207	GAA	2	6	3471	3476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183626
39	NC_017207	AAC	2	6	3483	3488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183626
40	NC_017207	ATT	2	6	3598	3603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183626
41	NC_017207	AAG	2	6	3631	3636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183626
42	NC_017207	AAG	2	6	3781	3786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183626
43	NC_017207	GTC	2	6	3817	3822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183626
44	NC_017207	AATT	2	8	3823	3830	50 %	50 %	0 %	0 %	384183626
45	NC_017207	ATT	2	6	3842	3847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183626
46	NC_017207	A	6	6	3861	3866	100 %	0 %	0 %	0 %	384183626
47	NC_017207	GAAT	2	8	3908	3915	50 %	25 %	25 %	0 %	384183626
48	NC_017207	ATT	2	6	3916	3921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183626
49	NC_017207	TAAT	2	8	4018	4025	50 %	50 %	0 %	0 %	384183626
50	NC_017207	TAT	3	9	4071	4079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183627
51	NC_017207	A	6	6	4111	4116	100 %	0 %	0 %	0 %	384183627
52	NC_017207	A	7	7	4173	4179	100 %	0 %	0 %	0 %	384183627
53	NC_017207	ATT	2	6	4185	4190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183627
54	NC_017207	GTTG	2	8	4247	4254	0 %	50 %	50 %	0 %	384183627
55	NC_017207	T	7	7	4527	4533	0 %	100 %	0 %	0 %	384183628
56	NC_017207	AT	4	8	4538	4545	50 %	50 %	0 %	0 %	384183628
57	NC_017207	T	6	6	4565	4570	0 %	100 %	0 %	0 %	384183628
58	NC_017207	GAT	2	6	4571	4576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183628
59	NC_017207	T	7	7	4576	4582	0 %	100 %	0 %	0 %	384183628
60	NC_017207	T	6	6	4630	4635	0 %	100 %	0 %	0 %	384183628
61	NC_017207	GATTT	2	10	4642	4651	20 %	60 %	20 %	0 %	384183628
62	NC_017207	TCTTT	2	10	4707	4716	0 %	80 %	0 %	20 %	384183628
63	NC_017207	TA	3	6	4746	4751	50 %	50 %	0 %	0 %	384183628
64	NC_017207	A	6	6	4777	4782	100 %	0 %	0 %	0 %	384183628
65	NC_017207	TTTA	2	8	5111	5118	25 %	75 %	0 %	0 %	384183629
66	NC_017207	TC	3	6	5153	5158	0 %	50 %	0 %	50 %	384183629
67	NC_017207	TTA	2	6	5193	5198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183629
68	NC_017207	AATA	2	8	5274	5281	75 %	25 %	0 %	0 %	384183629
69	NC_017207	TTTG	2	8	5289	5296	0 %	75 %	25 %	0 %	384183629
70	NC_017207	T	6	6	5308	5313	0 %	100 %	0 %	0 %	384183629
71	NC_017207	ATA	2	6	5702	5707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183630
72	NC_017207	TAA	2	6	5751	5756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183630
73	NC_017207	TCT	2	6	5779	5784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183630
74	NC_017207	AT	3	6	5850	5855	50 %	50 %	0 %	0 %	384183630
75	NC_017207	GAT	2	6	5860	5865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183630
76	NC_017207	AAT	2	6	5876	5881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183630
77	NC_017207	TAG	2	6	6120	6125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183631
78	NC_017207	ATT	2	6	6387	6392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183632
79	NC_017207	ATT	2	6	6427	6432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183632
80	NC_017207	AAC	2	6	6472	6477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183632
81	NC_017207	AGA	3	9	6480	6488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183632
82	NC_017207	TAT	2	6	6505	6510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183632
83	NC_017207	A	6	6	6575	6580	100 %	0 %	0 %	0 %	384183632
84	NC_017207	AC	3	6	6597	6602	50 %	0 %	0 %	50 %	384183632
85	NC_017207	T	6	6	6609	6614	0 %	100 %	0 %	0 %	384183632
86	NC_017207	TAT	2	6	6622	6627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183632
87	NC_017207	GCAT	2	8	6641	6648	25 %	25 %	25 %	25 %	384183632
88	NC_017207	AGA	2	6	6711	6716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183632
89	NC_017207	TGA	2	6	6723	6728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183632
90	NC_017207	TAT	2	6	6769	6774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183632
91	NC_017207	TCA	2	6	6780	6785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183632
92	NC_017207	TTA	2	6	6790	6795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183632
93	NC_017207	T	7	7	6825	6831	0 %	100 %	0 %	0 %	384183632
94	NC_017207	AC	3	6	6875	6880	50 %	0 %	0 %	50 %	384183632
95	NC_017207	AGA	2	6	6921	6926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183632
96	NC_017207	TAA	2	6	6945	6950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183632
97	NC_017207	TCT	2	6	7050	7055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183632
98	NC_017207	AAG	2	6	7073	7078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183632
99	NC_017207	TTA	2	6	7099	7104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183632
100	NC_017207	ACAA	2	8	7128	7135	75 %	0 %	0 %	25 %	384183632
101	NC_017207	AT	3	6	7149	7154	50 %	50 %	0 %	0 %	384183632
102	NC_017207	ATAC	2	8	7299	7306	50 %	25 %	0 %	25 %	384183632
103	NC_017207	GAA	2	6	7318	7323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183632
104	NC_017207	GAA	2	6	7342	7347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183632
105	NC_017207	TTA	2	6	7405	7410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183632
106	NC_017207	ATG	2	6	7428	7433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183632
107	NC_017207	A	6	6	7434	7439	100 %	0 %	0 %	0 %	384183633
108	NC_017207	ACA	2	6	7470	7475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183633
109	NC_017207	TTTTC	2	10	7480	7489	0 %	80 %	0 %	20 %	384183633
110	NC_017207	AAT	2	6	7497	7502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183633
111	NC_017207	ATG	2	6	7516	7521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183633
112	NC_017207	A	7	7	7528	7534	100 %	0 %	0 %	0 %	384183633
113	NC_017207	ATT	2	6	7539	7544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183633
114	NC_017207	CAA	2	6	7545	7550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183633
115	NC_017207	A	7	7	7697	7703	100 %	0 %	0 %	0 %	384183634
116	NC_017207	GA	3	6	7712	7717	50 %	0 %	50 %	0 %	384183634
117	NC_017207	A	7	7	7739	7745	100 %	0 %	0 %	0 %	384183634
118	NC_017207	GGA	2	6	7766	7771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384183634
119	NC_017207	AAT	2	6	7802	7807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183634
120	NC_017207	AAC	2	6	7829	7834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183634
121	NC_017207	ATA	2	6	7838	7843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183634
122	NC_017207	TC	3	6	7856	7861	0 %	50 %	0 %	50 %	384183634
123	NC_017207	GAA	2	6	7922	7927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183634
124	NC_017207	TA	4	8	7933	7940	50 %	50 %	0 %	0 %	384183634
125	NC_017207	TTG	2	6	7956	7961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183634
126	NC_017207	TAA	2	6	7972	7977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183634
127	NC_017207	ATG	2	6	7998	8003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183634
128	NC_017207	ACA	2	6	8023	8028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183634
129	NC_017207	A	6	6	8033	8038	100 %	0 %	0 %	0 %	384183634
130	NC_017207	T	6	6	8099	8104	0 %	100 %	0 %	0 %	384183634
131	NC_017207	TGG	2	6	8134	8139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384183634
132	NC_017207	A	6	6	8159	8164	100 %	0 %	0 %	0 %	384183634
133	NC_017207	AAG	2	6	8172	8177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183634
134	NC_017207	GTAGC	2	10	8211	8220	20 %	20 %	40 %	20 %	384183634
135	NC_017207	TTA	2	6	8242	8247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183634

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.